私たちの研究の目標は、さまざまな細胞機能を制御するシグナル伝達ネットワーク・代謝制御ネットワークのメカニズムを「システム」として理解することです。私たちは実験的方法とコンピュータ・シミュレーションの両方を用いてシステム生物学という観点から細胞の機能を理解しようとしています。

インスリン作用のトランスオミクスネットワーク

現在私たちは、次の3つの研究プロジェクトを重点的に実施しています。

1. インスリンシグナル伝達のトランスオミクス解析
2. インスリン作用の時間情報コーディング
3. 多細胞組織の情報伝達
4. 経口糖摂取に応答するヒト血中分子の時間パターン

詳細は研究紹介またはラボ紹介動画をご覧ください。

大学院は生物科学専攻および新領域・メディカル情報生命専攻（兼担）です。学部教育としては生物情報科学科を担当しています。また、2020年度から大学院医学系研究科（医学博士課程）を兼担することになりました。医学部・歯学部卒業（見込）で黒田ラボへの進学を考えている方は、是非こちらをご検討ください（募集要項、添付資料）。

「人材の多様性」が私たちの研究室の揺らぐことのない基本理念です。他学部、他大学の異なったバックグラウンドを持つ学生さんやポスドクなど大歓迎です。特に、糖代謝や2型糖尿病などに関連するトランスオミクスをマウス、ヒトを対象に解析を開始しています。医師でシステム生物学やトランスオミクスに興味のある方の参加も歓迎します。

黒田研では特任研究員を随時募集しております。いつでも雇えます。興味のある方はこちら。

私たちの研究は新学術領域研究(研究領域提案型)「代謝アダプテーションのトランスオミクス解析領域」に採択されています。

お知らせ

[セミナー情報]

富井健太郎博士セミナー 06月06日(月)　Zoom　10時00分~

[その他]
黒田研に興味のある方のラボ訪問を歓迎いたします。ラボ訪問を希望する方は、事前にメール等でお気軽にご相談ください。詳しくはこちら。

更新履歴

22.05.17 富井健太郎博士セミナー 2022年06月06日(月)　Zoom　10時00分~
22.04.26 インスリン刺激下で細胞増殖を促進する分子間相互作用ネットワークを生体分子の大規模計測データから解明した論文がiScience誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
22.04.05 【中古】仮面ライダーバトルガンバライド 001弾仮面ライダーオーズタカトラーター【レア】 No.001-009を更新しました。新メンバーのメッセージと写真を追加しました。
22.04.01 当店厳選のNY買い付け一点物。【SALE】【中古】【WOMENS】ADIDAS（アディダス） MADE IN ITALY ADILETTE アディレッタ [DEAD STOCK]を更新しました。特任研究員として、大原隆之と永田隆平が参加しました。また新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の修士課程に本司明日香が参加しました。また、廣中謙一が株式会社ナレッジパレット、寺川瑛がエーザイ株式会社、植松沙織がDivision of Nutritional Sciences, Cornell University、栗林梨沙が東京医科歯科大学に異動しました。
22.04.01 トランスオミクスネットワークにより制御される代謝フラックスに関する総説がBiochemical Journal誌に掲載されました。
22.03.25 若本祐一准教授セミナー 2022年04月27日(水)　Zoom　16時00分~
22.03.06 清水秀幸教授セミナー 2022年03月30日(水)　Zoom　16時00分~
22.02.10 数理モデルを用いた肥満における代謝変化と制御の定量的理解についての論文がiScience誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
また、糖投与後のヒトにおける血中分子の時間変化の特徴に関する論文がnpj Systems Biology and Applications誌に掲載されました。
22.01.31 〇【ミキハウス】【SALE】帽子7500【3,980円以上で送料無料(国内)】を更新しました。客員研究員として、理研iTHEMSの入谷亮介研究員が参加しました。
21.12.23 山西芳裕教授セミナー 2022年03月14日(月)　Zoom　16時00分~
21.12.23 Prof. Shalev Itzkovitz セミナー 2022年03月10日(木)　Zoom　16時00分~
21.12.08 沖真弥准教授セミナー 2022年02月10日(木)　Zoom　16時00分~
21.12.08 池上高志教授セミナー 2021年12月21日(火)　Zoom　16時00分~
21.10.21 BD/Maltine Girls Wave(Blu-ray) (Blu-ray+CD)/オムニバス/AVXD-91680を更新しました。新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の修士課程に王一然が入学しました。
21.10.13 落合博博士セミナー 2021年11月16日(火)　Zoom　16時00分~
21.09.30 Prof. Alexander Hoffmann セミナー 2021年10月27日(水)　Zoom　10時00分~
21.09.16 細胞間のばらつきと情報に関する総説がCurrent Opinion in Systems Biology誌に掲載されました。
21.08.27 二階堂愛博士セミナー 2021年09月14日(火)　Zoom　17時00分~
21.08.23 白井均樹氏セミナー 2021年09月01日(水)　Zoom　16時00分~
21.06.21 研究紹介を更新しました。
21.06.14 研究紹介を更新しました。
21.06.07 『Kahiko(カヒコ)』公式通販ファッション雑貨チャーム/キーホルダー/ハンドミラー 2202740692011 Kahiko 公式 [レイベアキーホルダー] カヒコハワイアンファッション雑貨チャーム/キーホルダー/ハンドミラー 4HCP2607を更新しました。理学部生物情報科学科の今井幹生、中山光浩が配属されました。
21.05.28 ラボ動画に、「研究紹介：細胞のばらつきはノイズではなく情報である」を追加しました。また、SlideShareに研究紹介スライドをいくつかアップロードしました。
21.05.24 ラボ動画に、「研究紹介：Trans-omic analysis of systemic glucose homeostasis」を追加しました。
21.04.26 重役秘書リナ７講談社楠木あると / モ－ニングＫＣ【中古】afbを更新しました。新メンバーの写真とメッセージを追加しました。
21.04.06 ２０２２SSモデル！！【ネコポス対応】MIZUNO ミズノエッジセーバー卓球アクセサリー 83JYA93150(ゴールド) ２０２２SSモデル！！を更新しました。医学系研究科分子細胞生物学専攻の博士課程に荻野智大、杉本光、理学系研究科生物科学専攻の修士課程に安部川拓海、战楚楚、新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の修士課程に森勇仁、中塚祐太が入学しました。また、小鍛治俊哉が奈良先端科学技術大学院大学データ駆動型サイエンス創造センター作村研究室の助教、和田卓巳が京都大学iPS細胞研究所未来生命科学開拓部門藤渕研究室の特定研究員として異動しました。
21.03.22 Paola Picotti教授セミナー 2021年05月17日(月)　Zoom　16時00分~
21.03.22 中戸隆一郎講師セミナー 2021年04月13日(火)　Zoom　14時00分~
21.03.17 ラボ動画に、「研究紹介：インスリンで制御される脂肪細胞糖代謝の速度論的トランスオミクス解析」と「研究紹介：トランスオミクス解析を用いた肝臓-筋肉間代謝サイクルの肥満による機能障害の制御機構の解明」を追加しました。
21.03.11 肝臓－筋肉の臓器連関代謝サイクルの肥満による制御異常を解明した論文がiScience誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
20.12.02 糖負荷後のマウス肝臓に対するトランスオミクス解析により肥満時の代謝制御の全貌を解明した論文がScience Signaling誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
20.10.21 中谷兄弟商会山中漆器茶筒水目桜ノミ目亀甲根来 W81-9を更新しました。李冬子が生物科学専攻の修士課程学生として参加しました。
20.10.06 特任助教の募集を開始しました。詳しくは神戸の靴屋神戸 KOBESHOES バックデザインが魅力的♪ 美脚すっきりパンプスマーレソフィスエアロサイドカットブーティ MIL192701 レディース歩きやすい。
20.09.22 電気刺激下の筋細胞におけるROS依存的ペントースリン酸経路の活性化をトランスオミクス解析により解明した論文がiScience誌に掲載されました。東京大学プレスリリースはこちら。電気通信大学のプレスリリースはこちら。
20.09.07 速度論的トランスオミクス解析によりインスリン作用による脂肪細胞の糖代謝制御の全貌を解明した論文がiScience誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
20.09.07 細胞のばらつきはノイズではなく情報であることを解明した論文がCell Reports誌に掲載されました。プレスリリースはこちら。
20.08.11 シングルセルレベルでのミトコンドリアATPの計測とモデリングを用いた筋細胞集団の多様性に関する論文がQuantitative Biology誌に掲載されました。
20.08.11 砂川玄志郎博士セミナー 2020年09月18日(金)　Zoom　16時00分~
20.06.22 KLS-06W エムケー精工レンジ台（ロータイプ）【メーカー直送】【送料無料】・上棚板付き・米収納量：20kg・1合、2合、3合の3レバー式・幅56×奥48×高137（117）cmを更新しました。理学部生物情報科学科の岩野宏太、大山隼礼が配属されました。
20.06.02 大学院理学系研究科・生物科学専攻の入試説明会が、2020年6月13日(土)にオンラインで開催されます。詳しくはこちら。
20.05.25 大学院新領域創成科学研究科・メディカル情報生命専攻の入試説明会が、2020年5月30日(土)および2020年6月6日(土)にウェビナーにて開催されます。黒田は6月6日に参加する予定です。詳しくはこちら。
20.04.27 田口善弘教授セミナー 2020年05月14日(木)　Zoom　15時00分~
20.04.20 ハリケーン H028-012C 150アップ2型ハンドルSET GB250クラブマン (90-94 MC10-1300001~1499999)(クロームメッキ)を更新しました。衛藤樹が荻窪病院研修医として異動しました。
20.03.04 シドニー大学のDavid James研究室との代謝フラックス解析の共同研究がiScienceに掲載されました。
20.02.17 山岸純平氏セミナー 2020年03月12日(木)　理学部3号館4階412号室　11時00分~
19.11.13 谷口雄一博士セミナー 2020年01月15日(水)　理学部3号館4階412号室　17時00分~
19.11.13 河岡慎平博士セミナー 2019年11月29日(金)　理学部3号館4階412号室　17時00分~
19.11.12 ICSB2019(International Conference of Systems Biology)が2019年10月31日から11月5日沖縄科学技術大学院大学OISTで開催されました。黒田がScientific chairとして参画するほかplenary talkも行いました。詳しくはこちら。
19.10.28 【2022モデル】スキーブーツ靴入門子供ロシニョール ROSSIGNOL 21-22 コンプJ1 COMP J1 ジュニアキッズを更新しました。白云帆がPhD candidateとして入学しました。
19.10.11 ノイズに対する細胞内情報伝達のロバストネスに関する論文がPhysical Review E誌に掲載されました。
19.09.09 Uwe Sauer博士セミナー 2019年10月18日(金)　理学部3号館4階412号室　17時00分~
19.09.04 血糖値を最小化する経口ブドウ糖摂取パターンを論理的にデザインする論文がnpj Systems Biology and Application誌に掲載されました。
19.08.19 Maren Diether 博士セミナー 2019年09月02日(月)　理学部3号館4階412号室　11時00分~
19.07.30 Dorota Badowska 博士セミナー 2019年09月03日(火)　理学部3号館4階412号室　17時00分~
19.07.29 稲垣毅教授セミナー 2019年09月06日(金) 理学部 3号館4階412号室 17時00分~
19.07.08 Christopher B. Newgard博士セミナー　09月18日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
19.06.27 宇田新介博士セミナー　07月31日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
19.06.18 坪井貴司博士セミナー　06月18日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
19.06.04 アンティーク風ペンダントランプステンドランプ照明間接照明アンティーク風ペンダントランプステンドランプ照明間接照明アンティーク風ステンドグラスペンダントランプパトリシア PSE取得 576l-689612 【玄関前渡送料無料-M】を更新しました。理学部生物情報科学科の前原秀紀が配属されました。
19.05.20 RIZAPとの共同研究によるRIZAPメソッドによる血中代謝物・ホルモン濃度の変動の論文が体力科学オンラインで公開されました
19.05.17 吉川雅英博士セミナー　05月17日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
19.05.13 トップページ記載内容を更新しました。
19.05.13 樹状突起スパインにおけるNMDARを介したCa²⁺上昇はロバストな情報伝達を示すことを見出した論文がBiophysical Journalに掲載されました。
18.05.13 トランスオミクスの総説がCurrent Opinion in Systems Biology誌に掲載されました。
19.05.08 トップページ・研究紹介を更新しました。
19.04.04 黒田研が所属する理学系研究科・生物科学専攻、および新領域創成科学研究科・メディカル情報生命専攻の大学院入試説明会が開催されます。オープンラボとして、4/27 (土), 5/12 (日), 6/15(土)は研究室見学やラボメンバーと対話することができます。ご興味があれば理学部3号館411号室までお越しください。
19.04.12 2020年秋冬 asics シューズ靴ランニングマラソンメンズ【アシックス】TARTHEREDGE 2 TENKA 1011A937-750 ターサーエッジ陸上ランニングシューズメンズの写真を更新しました。
19.04.12黒田研が所属する理学系研究科・生物科学専攻、および新領域創成科学研究科・メディカル情報生命専攻の大学院入試説明会が開催されます。オープンラボとして、4/27 (土), 5/12 (日), 6/15(土)は研究室見学やラボメンバーと対話することができます。ご興味があれば理学部3号館411号室までお越しください。
19.04.12 【送料無料】中がみえるガラスフタ。名称の由来となった欧州屈指の芸術も盛んな伝統ある街、ハンブルクに相応しい美しいヘアライン加工。【公式】フィスラー両手鍋 20cm ハンブルクシチューポットガラスフタ付き IH・ガス火対応 Fissler メーカー公式ドイツ製ステンレス製 Hamburg 鍋ロゴ入り目盛り付き 081-110-20-000の写真を更新しました。
19.04.04 TIG溶接機用タングステン 1.6mm 直流・交流灰(TIG溶接・アルゴン溶接・消耗品・スペアパーツ）を更新しました。守田啓悟特任研究員が着任し、新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の博士課程に植松沙織、同修士課程に首藤みお、理学系研究科生物科学専攻の修士課程に高橋美琴が入学しました。また、藤井雅史が、広島大学大学院統合生命科学研究科数理生命科学プログラム助教、幡野敦が理化学研究所統合生命医科学研究センター特別研究員として異動しました。
19.03.09 第４回生活習慣病とがんの代謝栄養メカニズム研究会にて、大野聡がポスター演題最優秀賞を受賞しました。
19.01.17 作村諭一博士セミナー　01月17日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
19.01.16 堀越桃子博士セミナー　01月16日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.12.18 リン酸化プロテオームデータを用いたシグナル伝達から細胞機能へのネットワーク再構成に関する論文がGenes to cellsに掲載されました。
18.12.12 本田直樹博士セミナー　12月12日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.11.13 Dr. Ernest Fraenkel セミナー　11月13日(火)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.11.12 Dr. Jamey D Young セミナー　11月12日(月)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.09.19 馬場健史博士セミナー　09月19日(水)　理学部3号館4F 412室　午後2時～
18.09.11 インスリン濃度に対するトランスオミクスネットワーク選択性の論文がiScienceに掲載され、第7巻の表紙にも選ばれました（ブラジリアンショーツインナーレディース下着はき心地バツグン MARCYN マルシン MARCYN (マルシン)ブラジリアンカットビキニショーツレディース下着インナーランジェリーインポート 559021、研究紹介動画（東京大学理学系研究科・理学部YouTubeチャンネル））。
18.09.07 守田啓悟博士セミナー　09月07日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.08.06 Dr. Andre Levchenko セミナー　08月06日(月)　理学部3号館4F 412室　午前10時～
18.08.30 ラボの紹介動画を作成しました！我々が今何を考えているのか、どのようなことを行なっているのか、興味がある方は是非ご覧ください。
18.07.31 島村徹平博士セミナー　07月31日(火)　理学部3号館3F 310室　午後3時～
18.07.31 大澤毅博士セミナー　07月31日(火)　理学部3号館3F 310室　午後2時～
18.07.26 時系列蛍光画像から筋管細胞を自動定量する方法を開発し、集団と個別とでS6K活性時系列の特徴が異なることを示した論文がCell Structure and Functionに掲載されました。
18.07.19 大川恭行博士セミナー　07月19日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.07.17 Dr. Luonan Chen セミナー　07月17日(火)　理学部3号館4F 412室　午後2時～
18.07.02 Dr. Roy Wollman セミナー　07月02日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.06.27 九州大学久保田研との共同研究であるin vivoでのインスリンの時間情報コードの論文がCell Systemsに掲載されました（日本語プレスリリース）。
18.06.14 厚いスポンジパッドで、衝撃からヒジを守ります！ DM[ディー＆エム]バレーボール肘サポーター・パッド付き・エルボーパッド［737］【2個までメール便OK】セミナー　06月14日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.06.01 ホームページをリニューアルしました。
18.05.11 水島昇博士セミナー　05月11日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.05.21 Mass Spectrometry and Proteomics 2018 (MSP2018)（第66回質量分析総合討論会・日本プロテオーム学会2018年大会・9^th AOHUPO合同大会）にて特任助教の幡野敦がMass Spectrometry and Proteomics 2018ベストプレゼンテーション賞最優秀賞を受賞しました。
18.04.13 大野博博士セミナー　04月13日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.04.03 ハンガーすべり止めハンガー用すべらないノンスリップエラストマースベリ止め L 10枚 5本分 HANGER お手持ちのハンガーがすべりにくいハンガーに♪ ハンガーすべり止めハンガー用すべらないノンスリップエラストマースベリ止め L 10枚 5本分 HANGERを更新しました。廣中謙一特任助教が着任し、新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の博士課程に江上陸、同修士課程に中村友佳・潘逸飞が入学しました。
18.03.14 好きな暗証番号に変更可能！ダイヤル式南京錠送料無料ダイヤル式南京錠幅約25mm 1個シャックル径約4mm 真鍮 3桁タイプ可変式ダイヤルロックダイヤル錠コンビネーションパドロックガードロックチェンジロック盗難防止防犯暗証番号宅配ボックスロッカーポストキャリーケース倉庫鍵 nankinl251pがnpj Systems Biology and Applicationsに掲載されました。
18.03.09 岡田随象博士セミナー　03月09日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
18.01.18 廣中謙一博士セミナー　01月18日(木)　理学部3号館3F 310室　午後5時～
17.12.27 信号修復技術と非線形ARXを用いた異なる時間スケールを含むシグナル伝達と遺伝子発現間のシステム同定に関する論文がPLoS Computational Biologyに掲載されました。
17.12.20 川上英良博士セミナー　12月20日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.12.19 David James研とのトランスオミクスの共著論文がCell Reportsに掲載されました。
17.12.16 異なる時間スケールでのトランスオミクスネットワークを介したシグナルジェネレータとしての代謝に関する総説がCurrent Opinion in Systems Biologyに掲載されました。
17.12.13 Dr. Alejandro Granados セミナー　12月13日(水)　理学部3号館4F 310室　午後5時～
17.11.21 CREST シンポジウム「The 1st International Symposium for Trans-Omics」を2017年11月21・22日に、東大本郷キャンパス、ＬＥＮＯＸ社ＬＥＮＯＸアジャスタブルハックソーフレーム１８０５７２３（３００＆２５０ｍｍ兼用） 1805723 (1072784)にて開催しました。多数の皆様に参加頂き、ありがとうございます。
17.11.17 Dr. H. Craig Mak セミナー　11月17日(金)　理学部3号館3F 310室　午後5時～
17.11.13 粟津暁紀博士セミナー　11月13日(月)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.10.30 齋藤稔博士セミナー　10月30日(月)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.10.01 唐沢康暉が、東京大学病院リハビリテーション部助教、国田勝行が、奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科計算生物学＆データ駆動型サイエンス創造センター助教、星野太佑が、電気通信大学情報理工学域共通教育部健康・スポーツ科学部会＆基盤理工学専攻　化学生命工学プログラム准教授として異動しました。また引き続き客員研究員として本研究室と共同研究を継続します。
17.09.29 島野　仁博士セミナー　09月29日(金)　理学部3号館3F 310室　午後5時～
17.09.27 ホンダ正規バイク整備書 CB-1 タイプII パーツリスト正規 5版 NC27-100 105 108 KAF Ax 車検パーツカタログ整備書【中古】と「低糖質食事法およびレジスタンス運動による血中代謝物・ホルモン濃度の変化」に関する共同研究を開始しました。詳しくはコチラ。
17.09.22 酒井寿郎博士セミナー　09月22日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.09.06 【PT最大15倍】オルビスパウダーウォッシュプラス ( つめかえ用 ) 50g ( ORBIS / 洗顔料 / 酵素洗顔パウダー / 洗顔パウダー ) 定形外なら送料224円～オルビスパウダーウォッシュプラスつめかえ用 50g [ ORBIS 洗顔料酵素洗顔パウダー洗顔パウダー ] +lt7+ セミナー　09月06日(水)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.07.20 近藤滋博士セミナー　07月20日(木)　理学部3号館3F 310室　午後5時～
17.06.30 平成29年度新学術領域研究(研究領域提案型)「代謝アダプテーションのトランスオミクス解析領域」（領域代表者　黒田真也）が採択されました。
17.06.30 CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域、第８回数理デザイン道場において、山本香織がポスター優秀賞を受賞しました。
17.06.08 秋光信佳博士セミナー　06月08日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.05.18 戎家美紀博士セミナー　05月18日(木)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.03.13 羊土社より実験医学増刊「生命科学で使える　はじめての数理モデルとシミュレーション」（神戸大学・小川渉博士との共著）が発売されました。
17.03.17 白髭克彦博士セミナー　03月17日(金)　理学部3号館4F 412室　午後5時～
17.03.01 Spineの小体積効果の論文がBiophysical Journalに掲載されました。
17.01.26 Metabolism-Centric Trans-OmicsのpreviewがCell Systemsに掲載されました。
17.01.01 柚木克之が、理化学研究所統合生命医科学研究センター融合領域リーダー育成プログラムの上級研究員として異動しました。また、引き続き客員研究員として本研究室と共同研究を継続します。

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